寶島義工團目前有五個帳號，用途說明如下:
個案執行
個案執行用的銀行帳戶:國泰世華光復分行
銀行代碼:013
帳號:016-03-003023-4
戶名：社團法人台灣寶島行善義工團
個案執行
個案執行用的郵局劃撥帳戶:帳號: 19766823
戶名：社團法人台灣寶島行善義工團
購買倉庫專戶
團部發展基金的銀行帳戶:國泰世華光復分行
銀行代碼:013
帳號:016-03-500010-4
戶名：社團法人台灣寶島行善義工團
帳戶源由:因寶島義工團成立多年來，一直是租賃倉庫，因種種因素近6年已搬遷3次, 搬遷需要耗費大量的人力及金錢，且倉庫租金也 是不小的負擔，因專款必需專用，故於98年08月14日成立團部倉庫專戶，非經理事會通過，不得動支。
會員專用帳戶
會員專款專用帳戶此為寶島義工團會員專用帳戶
提撥準備金專用帳戶
依社會團體財務處理辦法第 15 條-社會團體應逐年提列準備基金，每年提列數額為收入總額百分之二十以下。但社會團體決算發生虧損時，得不提列。前項基金及其孳息應專戶存儲，非經理事會通過，不得動支。
因專款必需專用，故於105年12月12日成立提撥準備金專戶